Le mutagène est également connu sous le liquide vert fluorescent. C'est une substance visqueuse, qui est dans presque toutes les causes du phénomène mutant et joue un rôle clé dans l'origine des Tortues. Il modifie la structure génétique de tous les organismes qui entrent en contact avec elle, et ainsi provoque une mutation. Elle fut créé par les laboratoires TGRI il y a une vingtaine d'années. Suite à certain scandale de pollution. Toute trace du mutagène a été détruit et sa recette de fabrication perdu à tout jamais. Aujourd'hui, il n'en reste plus aucune trace. Néanmoins, le gouvernement à pour projet de capturer un nombre croissant de mutant afin d'extraire cette fameuse recette directement dans leur structure d'ADN et créer ainsi une armée de super soldat endoctrinée celons leur idéaux.